A medida que el número de pasajeros de BART ha aumentado durante los últimos cinco años, el sistema ha desarrollado una escasez de estacionamiento en las estaciones. En un día laborable típico, muchos de los estacionamientos de BART se llenan antes de las 7:30 AM. Entre quienes no logran conseguir un espacio, algunos han encontrado formas alternativas de acceder a BART, mientras que otros se resignan a conducir al trabajo. Sin embargo, en medio de la crisis de estacionamiento de BART, un anticuado vacío legal que permite el estacionamiento del aeropuerto/a largo plazo en las estaciones agrava aún más esta escasez de estacionamiento.
El Programa de Estacionamiento del Aeropuerto/a Largo Plazo de BART, lanzado en 2007, permite a los pasajeros comprar permisos de estacionamiento a largo plazo para estacionar en las estaciones de BART en viajes de BART hacia/desde los aeropuertos y otros usos a largo plazo asociados con viajes de BART. Los pasajeros pueden comprar un permiso a largo plazo por $6 a $7 por día en cualquier estación con estacionamiento, excepto West Oakland y Coliseum. El programa se lanzó para fomentar el uso de BART hacia SFO, y ha persistido a medida que el número de pasajeros ha crecido alrededor de un 30 por ciento en los últimos nueve años. En comparación con las tarifas de estacionamiento del aeropuerto que al menos duplican o triplican el costo, el programa ofrece una relativa ganga para el almacenamiento de automóviles a largo plazo.
A pesar de sus beneficios, el Programa de Estacionamiento del Aeropuerto/a Largo Plazo no encaja con las políticas de acceso a las estaciones de BART ni con su misión principal. El estacionamiento en las estaciones de BART generalmente no es el uso más alto y mejor del terreno, y representa la prioridad de acceso más baja en la mayoría de las estaciones de BART. Sin embargo, donde se proporciona estacionamiento, es en el mejor interés de todos garantizar que esos espacios generen pasajeros diarios, tanto desde una perspectiva financiera (maximizando la recuperación por tarifas) como desde una perspectiva ambiental y de alivio de congestión (reduciendo las millas recorridas por vehículo, o VMT).

La Jerarquía de Diseño de Acceso a las Estaciones de BART incluye el estacionamiento de automóviles a corto plazo como su prioridad más baja, pero no menciona el estacionamiento a largo plazo.
El Programa de Estacionamiento del Aeropuerto/a Largo Plazo limita el número de pasajeros y pierde dinero. Durante una semana laboral típica, un espacio de estacionamiento de BART suele generar alrededor de diez viajes, mientras que un permiso de estacionamiento del aeropuerto a largo plazo generaría dos viajes. Al comparar los viajes de traslado a San Francisco con el estacionamiento a largo plazo para SFO, el Programa de Estacionamiento del Aeropuerto/a Largo Plazo queda más o menos parejo en algunas estaciones, pero pierde una cantidad sustancial de dinero en otras. En relación con los ingresos generados por un espacio diario de estacionamiento disuasorio, el estacionamiento a largo plazo puede perder hasta $18 por espacio en una semana:



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